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侵染葡萄的主要病原菌中,有哪些进行了全基因组测序?

三农 AIOT农民 2022-07-27 08:32 0 17823

侵染葡萄的主要病原菌中,有哪些进行了全基因组测序?

在侵染葡萄主要的病原菌中,已有3类菌经不同的研究团队,进行了全基因组的测序。

(1)葡萄霜霉菌(Plasmopara viticola)。2017年,葡萄霜霉菌首次全基因组测序的成果以“Genome sequence of Plasmopara viticola and insight into the pathogenic mechanism”为题在线发表在Scientific Reports杂志上。该成果由广西农科院重点实验室葡萄分子设计育种团队,与中国农业大学、北京理化测试中心、上海交通大学等单位合作完成。研究人员组装得到约101.3Mb的高质量葡萄霜霉菌全基因组序列,并成功预测出共17000多个编码基因和大量不同类型的致病相关蛋白。

(2)葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea)。葡萄座腔菌是引发葡萄溃疡病的病原菌之一。2018年,葡萄座腔菌首次全基因组测序的成果以“Comparative genome and transcriptome analyses reveal adaptations to opportunistic infections in woody plant degrading pathogens of Botryosphaeriaceae”为题在线发表在DNA Research杂志上。该成果由中国农业大学赵文生和李兴红团队合作完成,研究人员组装得到约43.3Mb的葡萄座腔菌全基因组序列。

(3)葡萄小镰刀菌(Neofusicoccun parvum)。葡萄小镰刀菌是引发葡萄溃疡病的病原菌之一。2019年,中国农业大学李兴红团队的博士论文“葡萄溃疡病菌侵染葡萄的组学基础与分子机制的初步研究”中提到,葡萄小镰刀菌首次全基因组测序完成,得到约42.1Mb的葡萄小镰刀菌全基因组序列。


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